研究方向
病原微生物的检测(***、细菌等)
疾病预防控制中心、出入境检验检疫局系统的实验室目前主要采用基于TaqMan探针法的定量PCR体系对病原微生物进行核酸水平的检测,而这些目前正在使用着的检测体系可以无缝地转移到QX200上,从而满足该类实验室对于检测结果的要求:灵敏度更高、重复性更好、无需依赖标准曲线的***定量结果,同时操作简便。
对于其他类型的研究实验室,也可以利用ddPCR灵敏度高的特点,对各种样品中的病原微生物展开***的研究。如HIV抗逆转录***治疗过程中***残留量的监控;HBV耐药突变的检测;HCV的分子分型;抗甲氧西林金黄色葡萄球菌的院内***监控;环境微生物不同功能基因之间的连锁分析等等。 准确度不完全依赖于扩增效率。苏州广州永诺数字PCR哪家好
与常规的PCR的方法相比,dPCR有很好的优势。
***定量
常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线,由于样品测定在各种条件上不会完全一致,会造成PCR扩增效率的差异,从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可以进行***定量。
样品需求量低
在检测珍贵样品和样品核酸存在降解时具有明显的优势。
高灵敏度
ddPCR本质上是将一个传统的PCR反应分成了数万个独立的PCR反应,在这些反应中可以精确地检测到很小的目的片段的差异、单拷贝甚至是低浓度混杂样品,且能避免非同源异质双链的形成。
高耐受性
由于目的序列被分配到多个微滴中,***降低了体系间的影响以及背景序列和***物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。 苏州广州永诺数字PCR哪家好数字PCR技术与高通量的二代测序技术,共同组成液体活检领域的两大利器。
我国***拥有完全自主知识产权的微滴式数字PCR仪MiniDrop™研发成功并投入生产。这是国内***微滴式数字PCR检测系统,能广泛应用于医疗、农业、环境等领域,未来,采用外周血、唾液、尿液、脑脊液等样本进行低成本、高灵敏、快速的无创检测成为可能。
MiniDrop™数字PCR仪由Creator微滴生成仪、Detector微滴检测仪、MD Microchip微流控芯片及MD Plotter数据分析软件组成,该系统的**为微流控微滴生成技术,采用原创性的油液,在40um微管道中利用气压驱动在2分钟内生成50万微滴,单次运行生成400万微滴,微滴体积达皮升级,检测线性范围达到5个数量级,各项指标均超越国内外主流产品。
dPCR的基本原理
目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。 数字PCR技术是公认的液体活检领域灵敏度比较好的检测方法。
相对于二代测序、基因芯片和定量PCR而言,数字PCR具备以下优势:
● 灵敏度可达到单个核酸分子:检测限低至0.001%,主要系为数字PCR可以实现靶标DNA/RNA的生物浓缩;
● 无需标准曲线活参照基因进行对比来测定核算量,可对靶分子起始量进行***定量,直接独处DNA分子的个数;
● 适合环境复杂样品的检测:终点PCR检测,不依赖Ct值,不依赖扩增效率,能克服PCR***剂的影响,避免样品间的交叉***问题,适合各类复杂环境中的样本进行***定量,如动血样、粪便、尿液、痰液、水样、土壤、植物等; 液体活检:早筛、用药、监测、复发。苏州广州永诺数字PCR哪家好
单次微滴生成仅需2分钟。苏州广州永诺数字PCR哪家好
数字PCR检测及分析原理在上世纪90年代就被提出来了,但是无奈受限于当时的技术条件,样本稀释及分配都是靠手工来完成的,受到很多因素的干扰和限制;并且结果分析对于研究者来说也十分枯燥与繁琐,因此在很长一段时间dPCR发展停滞不前。后来由于微流控技术与微纳集成制造工艺的发展解决了dPCR过程中的几个关键技术问题,推动了dPCR的研究与商业化的发展。
目前根据dPCR样本稀释分配的方式,基本可分为三大类,一种是基于大规模集成微流控芯片;第二种是使用微反应室/孔板;第三种是微滴式。但不论是走芯片式还是微滴式,其基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或者微滴当中,每个反应器的核酸模板数少于1或者等于1。经过PCR扩增之后,有一个核酸分子的模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,可以推算出原始溶液的核酸浓度。 苏州广州永诺数字PCR哪家好
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