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天津RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒哪家好

来源: 发布时间:2021-04-19

QuantSeq Data Analysis:

63.02   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-2 GB2 GB

63.06SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-6 GB6 GB

63.12SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-12 GB12 GB

63.25SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-25 GB25 GB

090.24QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24   runs24

091.24QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24

093.03QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

093.06QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB

094.03QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

094.06QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB 一个好的Lexogen试剂盒需要具备哪些特点您知道吗?天津RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒哪家好

    SLAMseq代谢标记试剂盒:标准的RNA-seq方法可以评估总RNA丰度,但不能解决RNA转录和降解整体动态水平的动力学问题。SLAMseq系列产品以时间作为RNA-Seq的一个新维度,能同时对新合成的和已有的RNA进行定量分析。产品优势:可进行转录组--RNA合成及降解的动力学分析;获取控制基因表达的新见解;建立刺激诱导的RNA转录和降解之间序列改变的模型;通过比较新生转录水平,***提高差异表达的分辨率;只需向RNA-Seq工作流添加两个步骤,无需pull-down实验或生化隔离;对于时间分辨的RNA-seq,整合了Lexogen’sSLAMseq标记试剂盒,QuantSeq3’mRNA-Seq文库构建试剂盒,以及SLAMdunk分析软件。工作流程:SLAMseq系列产品是基于一种新的全转录组定量、快速和可靠的标记方法:通过硫醇(SH)烷基化标记用于RNA的代谢测序1。用核苷酸类似物4-硫代嘌呤(4-Thiouridine,S4U)与细胞孵育,S4U被细胞摄入,并整合到新转录的,新生的RNA中。该工作流程的关键特点是烷基化步骤,使用碘乙酰胺(iodoacetamide,IAA)修饰S4U核苷酸,导致核苷酸在逆转录过程中发生转化。因此,S4U标记的转录本,在测序读取过程中,会导致胸腺嘧啶变成胞嘧啶(T>C)。 天津RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒哪家好Lexogen试剂盒有哪些分类呢?

PCR Add-on Kit for Illumina:用于Illumina平台的PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix、酶Mix和兼容的P7引 物,用于qPCR分析确定PCR的循环数。还包括再扩增引物,其可用于再扩增 Single-index(i7)文库。该Add-on Kit与QuantSeq及CORALL文库制备试剂盒兼容。

020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96

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    RiboCoprRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠)性能表现:RiboCop可高效地去除人类、大鼠和小鼠RNA样本中的rRNA(高达)。即使是高度降解的样本如FFPE(第3列),同样可以用RiboCop去除rRNA。通常回收率为RNAinput量的1-3%,同时高度取决于input的材料。此外,RiboCop的重复性极好。对于input量为100ng或10ng的UHRR样本,重复结果的相关性R2分别为。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒%的rRNA去除效率。RiboCop去除rRNA后,建库并在HiSeq仪器上测序。测序结果与rRNA参考序列比对,并以对应的未***rRNA的文库为参考进行定量。表格中的数据为100ng总RNA每反应的input量。UHRR—通用的人类参考RNA;HBRR—人类大脑参考RNA;mtrRNA—线粒体rRNA。 Lexogen试剂盒的优点有很多。

Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。

优势:

l 准确评估转录本浓度;

l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;

l 准确检测差异表达;

l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;

l 运算速度超快,且占用内存小。

工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?天津RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒哪家好


云生物的Lexogen试剂盒产品种类繁多。天津RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒哪家好

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 天津RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒哪家好